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反滲透膜是反滲透純水設備的核心部件。反滲透能大量去除水中細菌、內毒素、膠體和有機大分子。但是，二氧化碳可以直接通過反滲透膜，反滲透產水的二氧化碳含量和進水的二氧化碳含量一樣。反滲透產水中過量的二氧化碳可能會引起產水的電導率達不到要求，另外還會導致產水的pH值偏酸。如果后端還有其他工藝，二氧化碳還將增加反滲透單元后面的混床中陰離子樹脂的負擔。
解決辦法一般有一下兩種，一種是在反滲透前通過加 NaOH 除去二氧化碳；另外如果水中的 CO2 水平很高，可通過脫氣將其濃度降低到大約 5-10 ppm，脫氣有增加細菌負荷的可能性，應將其安裝在有細菌控制措施的地方，例如將脫氣器安在一級與二級反滲透之間。
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